Goed gefokte Toypoedels gelden als fitte metgezellen, maar door hun kleine formaat hebben ze rastypische risico's voor knieën, ogen en bloedstollingsstoornissen. Een gezondheidsbewuste fokker vermijdt extreme verdwerging om het skelet van de lijn te beschermen en zet gericht diagnostiek in, zoals de Deutscher Pudel-Klub e.V. (de Duitse poedelvereniging) die bijvoorbeeld voorschrijft.
Bij de gewrichten staat patellaluxatie (het uitschieten van de knieschijf) voorop, aangevuld met onderzoeken op elleboogdysplasie (ED). Klinisch tastonderzoek en röntgenonderzoek van de ouderdieren verkleinen het risico voor de pups aanzienlijk. Ook de ogen moeten vóór de inzet in de fokkerij door een specialist klinisch worden onderzocht op cataract (grijze staar).
Voor meerdere erfelijke aandoeningen bij de Toypoedel bestaan gevestigde DNA-tests. Daartoe horen progressieve retina-atrofie (prcd-PRA), een voortschrijdende netvliesdegeneratie, en neonatale encefalopathie met epileptische aanvallen (NEWS). Andere relevante thema's in het ras zijn de bloedstollingsstoornis ziekte van Von Willebrand type I (vWD1) en degeneratieve myelopathie (DM). Een DNA-test laat betrouwbaar zien of een ouderdier vrij, drager of lijder is. Bij prcd-PRA, NEWS en DM combineert een betrouwbare fokker dragers uitsluitend met aantoonbaar vrije partners, bij de ziekte van Von Willebrand type I zet hij alleen vrije dieren in, zodat geen enkele pup de betreffende mutatie van beide ouders kan erven. Let later in het dagelijks leven op een gezond gewicht en een gewrichtsvriendelijke opvoeding (weinig traplopen en geen sprongen van hoge banken in het eerste jaar), en houd bij ingrepen door de dierenarts de bloedstolling in je achterhoofd.